转自:迈克生物
(资料图)
癌症是威胁人民健康的一大“杀手”。
世界卫生组织国际癌症研究机构(IARC)公布的全球最新癌症数据表明,2020年全球癌症新发病例数为1930万,死亡人数为990万,亚洲的癌症发病率和致死率高达49.3%和58.3%,中国在其中占比最高。该研究保守预计2040年将会有2840万例新发癌症[1]。
因此全球的癌症负荷不容小觑,肿瘤的防治仍是一场持续的攻坚战。
2000年,为了应对全球癌症发病率和死亡率的不断上升,呼吁全社会共同关注、支持和参与肿瘤防治事业。国际抗癌联盟和世界卫生组织将2月4日设立为“世界癌症日”。
随着诊疗技术的不断进步,癌症得到了一定的控制与治疗,世界卫生组织提出:三分之一的癌症可以通过早期发现得到根治。故早诊早治是提高癌症生存率的关键[2]。
癌症的诊断方式包括组织活检与液体活检等,其中组织活检需通过切取或穿刺等方式取得肿瘤病变组织进行病理学检查,可能给患者带来痛苦和并发症风险,且耗时较长;而液体活检仅需通过获取患者体液即可进行检查,更为简便,患者接受度也更高,在肿瘤诊疗中应用前景广阔。
常用的肿瘤液体活检检测方法有NGS、ARMS-PCR等,NGS检测报告周期长,检测费用较高;ARMS-PCR目前较多应用于肿瘤基因单个突变位点的检测,易受扩增抑制物影响。因此灵敏度高、报告时间短、稳定性好且应用领域更广泛的平台能够更好的为临床上进行肿瘤突变检测提供助力。
数字PCR(dPCR)作为第三代核酸检测技术,突破了第二代qPCR的局限性,耐抑制性强且具有极高的灵敏度,具有检测通量高,检测速度快,操作便捷等优势,能够广泛应用于肿瘤早期诊断、指导用药、治疗效果监测以及预后评估等方面。
数字PCR与NGS和ARMS-PCR的对比[3]
数字PCR分类
基于不同的样品划分方式,dPCR可以分为基于集成流路(IFC)芯片、微反应室/孔板和液滴的dPCR[3]。
IFC芯片通过高密度的微阀结构设计在芯片上制备出成百上千个皮升级的独立单元进行样本划分;微孔式dPCR将样本分配到高通量的微孔或微量通道中,反应单元体积与单元是固定的;